Datenmanagement im Microverse

Das Microverse-RDM-Team bietet in Zusammenarbeit mit den Digital Research Services der Universität Jena während der gesamten Projektlaufzeit Beratung und praktische Unterstützung an und hilft Ihnen dabei, Ihren Datenmanagementplan zu entwerfen und zu verfeinern, geeignete Metadatenstandards und Repositorien auszuwählen sowie passende Lizenzen zu finden.

Wir bieten praktische Anleitung zur Infrastruktur, einschließlich Speicherung und Datensicherung, elektronischer Laborjournale (ELNs) und Versionskontrolle von Code. Bei der Veröffentlichung und zum Projektabschluss unterstützen wir Sie bei der Kuratierung von Datensätzen und Software, der Erstellung hochwertiger Metadaten sowie der Hinterlegung der Ergebnisse in vertrauenswürdigen Repositorien, um deren langfristige Aufbewahrung und Auffindbarkeit sicherzustellen.

Services und Tools

Research Data Manager Organiser (RDMO)

RDMO ist eine Webanwendung, die die strukturierte Planung und Durchführung des Datenmanagements in einem wissenschaftlichen Projekt unterstützt.Für die Microverse-RDMO-Instanz haben wir eine Vorlage für einen strukturierten Datenmanagementplan (DMP) für laufende Projekte entworfen. Als Teil dieser Vorlage stellen wir Informationen zu Standards für die Datenberichterstattung (Mindestanforderungen an die Informationen), zur Qualitätskontrolle bei der Datenerfassung und zu Repositorien für die Datenveröffentlichung bereit. Die aus einem solchen Dokument gewonnenen Informationen helfen uns, die Anforderungen an ein Datenspeichersystem besser zu verstehen und unsere Infrastrukturentwicklung entsprechend zu gestalten. Später werden wir Speicherplatz für experimentelle Daten auf einem zentralen Speichersystem ausschließlich auf der Grundlage dieses DMP zuweisen. Darüber hinaus kann ein solcher DMP dazu verwendet werden, einen Antrag auf Rechenressourcen (HPC) beim Universitätsrechenzentrum (URZ) zu begründen, in einem anderen DMP für einen Förderer wiederverwendet oder als Teil eines Forschungsberichts aufgenommen werden.

Bilddatenverwaltungsplattform OMERO

Wichtigste Funktionen:

Unterstützt über 140 Bilddateiformate, darunter alle gängigen Mikroskopformate
Hochladen von Daten über die Desktop-App oder die Befehlszeile
Anzeigen, Organisieren und Kommentieren von Bilddaten
Freigabe von Daten mithilfe des Berechtigungssystems „Gruppen/Benutzer“

Die Microverse-OMERO-Instanz ist über das Intranet der Universität und externe Netzwerke per HTTPS-Protokoll mit dem Webclient oder per WSS-Protokoll mit der Desktop-App oder Software von Drittanbietern (z. B. ImageJ) erreichbar. Die insgesamt verfügbare Speicherkapazität beträgt ca. 145 TB. Der Server wird regelmäßig gesichert.

Der Zugriff auf den Server kann auf schriftliche Anfrage an das Microverse-RDM-Team oder über das Microverse Imaging Center gewährt werden. Die meisten Datensätze in der Microverse-OMERO-Instanz sind privat. Der Zugriff auf ein privates Projekt erfordert die Genehmigung des Projektleiters oder des für die Daten verantwortlichen Datenmanagers.

Dienstleistungen der Universität Jena

Schulung und Beratung

In Zusammenarbeit mit dem Helpdesk für Forschungsdatenmanagement der Universität bieten wir Workshops zu den Themen Forschungsdatenmanagement, Best Practices für Skripte und Workflows, OMERO-Tutorials sowie Metadatenstandards an.

Persönliche Beratung

Alle zwei Wochen, donnerstags, 9:00 bis 12:00 Uhr

Microverse Center Jena
Rosalind-Franklin-Str. 5
Raum 2058
07745 Jena

Courses

TBA